まず、六回表にド派手な花火が国立で打ち上げられ、風の影響で煙が球場内に流入して１分ほど中断。さらに、七回表にはライブの演出で使われた風船がグラウンド内に飛来して再び中断され、警備員が回収する事態となった。
それを受け、嵐が所属するジャニーズ事務所は、公式サイトで「本日、国立競技場にて行っておりました、嵐フェス２０２０の収録にあたり、風船及び花火による演出の煙により、隣接する神宮球場にて試合中の『ヤクルト対中日』戦を２度ほど意図せず中断させてしまう事となりました」（原文ママ）と事情説明。
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続けて「神宮球場、両球団選手及び関係者、視聴者の皆さまには、ご迷惑をお掛け致しました事を、深くお詫び申し上げます」と謝罪した。ジャニーズから両球団には事前にコンサートを行う連絡をしていた。
「嵐フェス２０２０」は１１月３日に有料配信することは発表されていたが、収録日は公表されていなかった。発表の際、メンバーは「誰も見たことのない新しい景色になる」などとコメントしていた。